تهدف كلية الهندسة الزراعة في جامعة البعث إلى مايلي :
• إعداد المختصين في مختلف ميادين الزراعة وتأهيل الطلاب وتزويدهم بمستوى عال من المعرفة في مجال اختصاصهم بشكل يواكب تقدم العلم والتقنية والحضارة العالمية.
• إجراء البحوث العلمية والدراسات المختلفة التي تسهم في التقدم العلمي والتقني في مجال الزراعة وخاصة مايهدف منها إلى إيجاد الحلول لمختلف القضايا التي تواجه التطور الاقتصادي والاجتماعي في الجمهورية العربية السورية والوطن العربي.
• تطوير وسائل وأساليب البحث والتعليم وأصول التدريس في مجال الزراعة بما في ذلك استخدام الوسائط المعلوماتية وتطوير المؤلفات التعليمية الجامعية وترجمتها والمساهمة في تعريب التعليم الجامعي في الوطن العربي في مجال العلوم الزراعية.
• تنظيم دورات التأهيل والتدريب والتعليم المستمر في مجالات تخصص الكلية.
• ترسيخ القواعد والقيم المعززة لبناء المجتمع العربي الاشتراكي الموحد وإذكاء الروح النضالية للطلاب.
• تربية شخصية الطالب العلمية والسياسية وإنماء وعيه القومي والاشتراكي وحبه للعمل.
• توجيه الطلبة نحو اختيار الاختصاصات العلمية والنشاطات الإنتاجية التي تناسب إمكاناتهم ، سواء في القطاع العام أو الخاص أو المشترك.
• تشجيع النشاط الثقافي والاجتماعي والرياضي في الحياة الجامعية.
• تشجيع الطلبة للالتحاق بالدراسات العليا في الكلية وتطوير البحث العلمي.
• توثيق الروابط الثقافية والعلمية مع الكليات والهيئات العلمية الزراعية المحلية والعربية والأجنبية .
• تحقيق أعلى مستوى من التفاعل بين الكلية بأقسامها المختلفة ومؤسسات ومنظمات المجتمع التي تتكامل مهامها وأهدافها مع مهام الكلية وأهدافها